Морской порт Поронайск расположен в центральной части острова Сахалин в заливе Терпения Охотского моря, в устье реки Поронай. Это единственный порт на восточном побережье острова, имеющий пункт пропуска через государственную границу Российской Федерации. Общая площадь акватории порта составляет 12,5 квадратных километров.